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當前位置:首頁資料下載prokazyme IaF170S說明書

prokazyme IaF170S說明書

發布時間:2018/9/17點擊次數:551

rokazyme生產和銷售用于研究,診斷和工業測試目的的新型酶。該公司成立于2006年,是冰島生物技術公司Prokaria的副產品,該公司后來合并為非營利性國有企業Matis。Prokazyme基于二十年的地熱生物勘探,微生物基因組學和酶發現。Prokazyme(作為中小企業)與馬蒂斯組成了一個研究聯盟,并共同參與了由歐盟資助的一些研究項目。持續的研發和與Matis的戰略聯盟使Prokazyme有機會開發大量不斷增長的嗜熱細菌和病毒基因數據庫,并繼續開發新的*酶產品。

Ice and Fire Phosporylation Kit / PNK and Alkaline phosphatase

冰和火磷酸化試劑盒/ PNK和堿性磷酸酶

Ice and Fire™磷酸化試劑盒包括用于核酸5'末端標記的優化試劑。

Ice and Fire™磷酸化試劑盒包括用于核酸5'末端標記的優化試劑。該新方案通過結合不耐熱蝦堿性磷酸酶(SAP)的低溫活性和熱穩定的ThermoPhage™多核苷酸激酶(PNK)的高溫活性,提供簡單的“一步”處理。蝦堿性磷酸酶從核酸的5'末端消化單磷酸,二磷酸和三磷酸,留下5'羥基。PNK催化γ磷酸從ATP轉移到核酸分子的5'-OH。在簡化的溫度控制程序中兩種酶的組合允許磷酸化核酸的快速和有效的5'末端標記。

可作為50個反應的套件提供。

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產品  :  IaF170S  | Ice and Fire kit 50反應  | 價格:220.00 EUR

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有關詳細信息,請參閱下文或下載說明書

背景:
Ice and Fire Phosphorylation試劑盒為核酸的5'末端標記提供了優化的試劑。簡單的方案利用低溫和高溫來控制不耐熱的蝦堿性磷酸酶(SAP)和熱穩定的ThermoPhage™多核苷酸激酶(PNK)在一種溶液和優化的反應緩沖液(專項技術申請中)中的活性。該試劑盒旨在用末端單磷酸,二磷酸或三磷酸標記DNA或RNA分子的5'末端。其他核酸如PCR產物,寡核苷酸,限制性消化的質粒DNA或復合物樣品RNA或DNA也可用該試劑盒標記。基材實際上可以是任何長度。具有5'-磷酸的核酸需要在激酶反應之前去磷酸化。該試劑盒包括蝦堿性磷酸酶和熱穩定多核苷酸激酶酶混合物。這允許在較低溫度下核酸的去磷酸化,然后在加入放射性標記的[γ-32 P] ATP之前加熱滅活磷酸酶并通過新型熱穩定多核苷酸激酶(1)進行標記。SAP變性和PNK反應在70℃下進行。加熱步驟后無法檢測到SAP活性,然后進行PNK反應。具有5'-羥基(-OH)基團的核酸也可以使用該試劑盒標記。在這種情況下,磷酸酶通過加熱直接滅活,然后加入γ放射性標記的ATP并在70℃溫育。SAP變性和PNK反應在70℃下進行。加熱步驟后無法檢測到SAP活性,然后進行PNK反應。具有5'-羥基(-OH)基團的核酸也可以使用該試劑盒標記。在這種情況下,磷酸酶通過加熱直接滅活,然后加入γ放射性標記的ATP并在70℃溫育。SAP變性和PNK反應在70℃下進行。加熱步驟后無法檢測到SAP活性,然后進行PNK反應。具有5'-羥基(-OH)基團的核酸也可以使用該試劑盒標記。在這種情況下,磷酸酶通過加熱直接滅活,然后加入γ放射性標記的ATP并在70℃溫育。

優點:

  •  

磷酸化核酸的有效5'末端標記,單鏈或雙鏈

  •  
  •  

酶活性的簡單溫度控制

  •  
  •  

在反應之間不需要額外的清除步驟如苯酚/chloroform或旋轉柱,僅SAP的熱變性

  •  
  •  

單管格式,簡化程序

  •  


應用:5' - 磷酸化DNA和RNA的終標記:

  •  

核酸酶保護測定

  •  
  •  

雜交印跡

  •  
  •  

定量PCR

  •  

產品組件:

10X反應緩沖液

SAP / PNK酶混合物

磷酸化的ssDNA寡聚體(10pmol /μL)用作陽性對照

套件未隨附的組件:

放射性標記的γ-ATP [32P]

ATP

無核酸酶水

議定書:

核酸5'放射性標記方案:冰與火磷酸化試劑盒提供對照和優化試劑,可快速方便地標記DNA或RNA

1)靶核酸的去磷酸化(SAP反應):
10x SAP / PNK緩沖液
2.5μLSAP/ PNK酶混合物1μL 
靶DNA / RNA 
10-100pmol無核酸酶水至
24μL在37°C孵育60分鐘

2)靶核酸的磷酸化(PNK反應):
在37℃溫育后,將樣品加熱至70℃。在70℃下15分鐘后,向反應中加入XμL放射性標記的[γ-32 P] ATP,相當于待標記末端的2-5摩爾過量ATP(例如使用7,000 Ci / mmol,150 mCi / ml [γ] -32 P] ATP,1μL約為25 pmol)。在70°C孵育另外30-60分鐘。冷卻至+ 4°C或置于冰上以阻止反應。

任選:加入1mM EDTA和/或在95℃加熱反應5分鐘以終止反應。

任選:通過旋轉柱(例如Qiagen核苷酸去除試劑盒,目錄號28304或等效的旋轉柱)或如Sambrook等所述的PAGE凝膠純化來清潔探針。(2)。

放射性標記的核酸現在可以使用了

第二議定書:

用于5'標記5'羥基化核酸的方案:Prokazyme Ltd也提供ThermoPhage TM PNK用于標記5'羥基化核酸,但Ice and Fire磷酸化試劑盒也可用于此類應用。

1)反應混合物
10x SAP / PNK緩沖液
2.5μLSAP/ PNK酶混合物1μL 
靶DNA / RNA 
10-100pmol無核酸酶水至
24μL在70℃孵育15分鐘以滅活SAP酶。

2)靶核酸的多核苷酸激酶5'標記:
將XμL放射性標記的[γ-32 P] ATP加入到相當于2-5摩爾過量ATP的反應中,待標記的末端(例如使用7,000 Ci / mmol,150 mCi) / ml [γ-32 P] ATP,1μL約為25pmol)。
在70°C孵育60分鐘。冷卻至+ 4°C或置于冰上以阻止反應。

任選:加入1mM EDTA和/或在95℃加熱反應5分鐘以終止反應。

任選:通過旋轉柱(例如Qiagen核苷酸去除試劑盒,目錄號28304或等效的旋轉柱)或如Sambrook等所述的PAGE凝膠純化來清潔探針。(2)。

放射性標記的核酸現在可以使用了

方案III:

沒有放射性ATP的磷酸化:該試劑盒也可用于在克隆程序等之前磷酸化5'羥基化核酸。

1)反應混合物
10x SAP / PNK緩沖液
2.5μLSAP/ PNK酶混合物1μL 
靶DNA / RNA 1-500pmol無
核酸酶水至
24μL在70℃孵育15分鐘以滅活SAP酶。

2)靶核酸的多核苷酸激酶5'磷酸化:
將ATP加入到反應中至終濃度為10-100μM(至少兩倍于核酸末端的磷酸化濃度)。
在70°C孵育60分鐘。冷卻至+ 4°C或置于冰上以阻止反應。

任選:通過旋轉柱(例如Qiagen核苷酸去除試劑盒,目錄號28304或等效的旋轉柱)或如Sambrook等所述的PAGE凝膠純化來清潔探針。(2)。

現在核酸已準備好用于克隆程序

評估協議:

如果需要確定特定放射性或如果研究人員想要評估反應效率,則可以使用以下評估方案。請注意,此評估需要閃爍計數器,閃爍液和DE81過濾器或等效儀器和組件。將1μL反應物稀釋至1/10并將1μL點稀釋至Whatman Inc.DE81過濾器(目錄號3658023)或其等同物。作為陽性對照,將相同的量放在一個不經過洗滌步驟的過濾器上。沒有酶混合物的反應溶液可用作陰性對照并用樣品洗滌。將樣品和陰性對照濾膜在400ml磷酸鈉緩沖液pH7中洗滌兩次30分鐘,干燥并放入閃爍計數瓶中,加入閃爍液并在液體閃爍計數器中計數放射性。為了確定標記的核酸的比活性,計算摻入反應中的總cpm并將其除以pmol中標記的核酸的量。

(#total cpm合并*稀釋因子*體積)/(#total pmol核酸)

預期的比活性:
當具有7000 Ci / mmol的比活性的[γ-32P] ATP用于激酶反應時,核酸應在參考日期標記至至少1×10 6 cpm / pmol。在放射性標記的ATP小瓶上標明的參考日32P的衰變可以計算為:(原始cpm /μl)/(2(天/ 14.3))

參考文獻:

Blondal,T.,Hjorleifsdottir,S.,Aevarsson,A.,Fridjonsson,OH,Skirnisdottir,S.,Wheat,JO,Hermannsdottir,AG,Hreggvidsson,GO,Smith,AV and Kristjansson,JK(2005)J Biol Chem, 280,5188-5194。

Sambrook,J.,Fritsch,EF和T.,M。(1989)Molecular cloning,a laboratory manual。冷泉港實驗室,紐約冷泉港。

 

 

 

 

貨號

品名

規格

價格

品牌

Cel136

Pustulanase (beta-glucanase) from environmental DNA

100 Units

 220.00 EUR

prokazyme

Cel136

Pustulanase (beta-glucanase) from environmental DNA

500 units

850.00 EUR

prokazyme

Gtfa163S

Glucansucrase (Alpha-glucanotransferase) from Lactobacillus reuteri

100 microliter

EUR 195

prokazyme

Gtfa163S

Glucansucrase (Alpha-glucanotransferase) from Lactobacillus reuteri

500 microliter

EUR 490

prokazyme

Elo127

Glucan elongation enzyme from environmental DNA

1000 Units

220.00 EUR

prokazyme

Rham142

Naringinase (Rhamnosidase A) from Thermomicrobia sp.

100 Units

280.00 EUR

prokazyme

Rham143

Hesperidinase (Rhamnosidase B) from Thermomicrobia sp.

100 Units

280.00 EUR

prokazyme

Bgl162

Beta-Glucosidase from Thermotoga neopolitana

100 units

220.00 EUR

prokazyme

Fucl123

Alpha-Fucosidase from environmental DNA

 30 units

 220.00 EUR

prokazyme

Agal104

Alpha-Galactosidase from Thermus brockianus

1000 Units

 220.00 EUR

prokazyme

Bgal112

Beta-Galactosidase from Thermus brockianus

100 Units

220.00 EUR

prokazyme

Bgal112

Beta-Galactosidase from Thermus brockianus

500 Units

850.00 EUR

prokazyme

Bglu110

Laminarinase/Lichenase from Rhodothermus marinus

200 Units

220.00 EUR

prokazyme

Adh131

Alcohol dehydrogenase from Geothermus vaporicella

100 Units

220.00 EUR

prokazyme

Lys164

ThermoPhage™ Lysozyme

0.1mg

220.00 EUR

prokazyme

Dlig119S

Tsc DNA ligase

500 Units

220.00 EUR

prokazyme

Dlig119L

Tsc DNA ligase

2000 Units

320.00 EUR

prokazyme

Dlig120S

DNA ligase

500 Units

220.00 EUR

prokazyme

Pnk162S

Polynucleotide kinase

500 Units

220.00 EUR

prokazyme

Pnk162L

Polynucleotide kinase

1000 Units

320.00 EUR

prokazyme

IaF170S

Ice and Fire kit

50 reactions

220.00 EUR

prokazyme

 

 

 

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